PCR quantitative

Hybridation On présentera : - le principe de l’hybridation ; - l’hybridation sur membrane ; - l’hybridation in situ. 2.2.3. Amplification On présentera : - l’amplification d’un ADN par PCR et la détection du produit de PCR ; - l’amplification du signal ; - la PCR quantitative ; - la PCR en temps réel. 2.2.4. Ligation de fragments d’ADN On présentera : - l’ADN recombinant ; - le clonage d’ADN ; - les banques d’ADN. 3. Applications à la biologie médicale 3.1. Applications

plateforme. la Biologie quantitative à haut débit. Version d´ cembre 2008 — mises a jour et compl´ ments : e e ` www.math.univ-toulouse.fr/biostat Elle apporte une expertise et un accompagnehttp ://math.univ-toulouse.fr/biostat/ ment pour l’utilisation et le développement de méthodologies statistiques et logiciels approActIvItéS priés. • Monter et accompagner des projets scientifiques impliquant la génération et l’analyse de tout type de ExpErtISE Contacts données quantitatives à haut débit Les animateurs

de la tularémie, ont été produites en Union Soviétique. Cette maladie est susceptible d’être transmise par voie respiratoire. Elle peut être rapidement fatale, avec une mortalité (chez les patients non traités) de 1/3. Le diagnostic par culture et PCR pour l’instant est difficile et il est surtout fait rétrospectivement et tardivement par sérologie. Le traitement repose essentiellement sur la Doxycycline qui est le traitement de référence avec la Gentamicine. 3.5 - La Peste La Peste est l’agent

I__I I__I INFORMATION SUR LE PATIENT SOURCE 24 VIH : Positif connu VHC : Positif connu 24 I__I Positif découvert Négatif Non identifié Inconnu 25 I__I Positif découvert Négatif Non identifié Inconnu 26 I__I Si sérologie VHC positive, virémie par PCR Positif connu Positif découvert Négatif Non identifié 27 VHB : Antigénémie HBS : Positive Négative Non identifié 26 Inconnu Inconnu 27 I__I 25 RÉACTION A L'ACCIDENT 28 29 30 31 32 33 34 35 36 SOINS IMMÉDIATS : Lavage Oui Non Antiseptique Oui

génomique fonctionnelle et de génétique quantitative. Nous avons vu que, à l’exception notable de Physcomitrella patens, les génomes nucléaires des végétaux ne se prêtent pas à une inactivation génétique ciblée, faute de méthodes de recombinaison homologue ; celles-ci représentent donc un enjeu de recherche majeur. Toutefois des collections de mutants d’insertion ont été développées ; elles permettent l’isolement de mutants par criblage par amplification PCR. Pour certaines de ces collections

centres de référence. * le dosage des lymphocytes CD4 ou T4 Les lymphocytes CD4 sont des cellules sanguines Leur dosage permet d’évaluer le déficit immunitaire. Ils se mesurent en nombre / mm3 * la charge virale ou PCR ARN VIH quantitative Cet examen permet de mesurer la quantité de virus par ml de sang. Il s’agit d’un examen coûteux, la méthode est lourde mais nécessaire pour évaluer l’évolutivité de la maladie VIH. Elle se mesure en copies.

et « co-infection du patient source par le VHB ou le VIH ». Les 37 cas (100,0 %) pour qui l’information était disponible avaient été exposés à un patient ayant un ARN du VHC détectable, contre 42 (85,0 %) parmi les 61 témoins. La charge virale quantitative du VHC était disponible pour 12 cas et 27 témoins. Dans l’analyse univariée non appariée, le risque de transmission de VHC s’est avéré être 11 fois plus élevé (IC 95 %, 1,1-114,1, p = 0,04) pour les soignants exposés à un patient source présentant

invalidées pour les gènes pkd2 et tpc ont été obtenues par recombinaison homologue. Pour chaque gène, deux fragments d’ADN génomique de la souche sauvage AX2, distants d’au moins 100 paires de bases (pb) et longs d’environ 300pb ont été amplifiés par PCR à partir d’oligonucléotides contenant des sites de restriction pour EcoRV, EcoRI et XbaI, voir figure 2.3 pour le détail. Ces fragments ont été introduits dans un plasmide (pBluescript KS+), en intercalant une cassette de 1,3kb codant pour un gène de

identifiés, d'autres analyses in silico sont nécessaires, telles que des analyses de clustering pour regrouper les gènes présentant le même profil d'expression. Enfin, les résultats seront souvent confirmés gène par gène par des méthodes telles que la PCR quantitative ou le Northern Blot. Les puces apportent principalement des données qualitatives (variation d'expression d'un gène) mais il est difficile de quantifier avec précision l'expression d'un gène avec la technologie des puces à ADN. L'utilisation des

1. Formulations - différents types: liquides complexes, solides, aérosols, pâtes - sous différentes conditions: chaud, froid, sous vide....... - Qualification des matières premières selon les critères qualité bien définis (GLP), dont détection quantitative et qualitative du profil olfactif de la matière première, par méthode chromatographique SPME. 2. Caractérisation physico-chimique des produits finis - Viscosité - pH - Propriétés mécaniques dynamiques - Test de performance de produits de nettoyage: