À côté de la conception de matériel informatique, Apple développe aussi de nombreux logiciels tant à destination du grand public que du monde professionnel. En premier lieu, Apple développe son propre système d'exploitation pour ses machines avec Mac OS X pour les Macintosh et iOS pour les appareils mobiles. Nombres de logiciels développés par Apple sont fournis avec les machines lors de leur achats. C'est le cas par exemple du célèbre logiciel multimédia iTunes, du navigateur Web Safari, du lecture vidéo QuickTime, de la suite multimédia grand public iLife comprenant iPhoto, iDVD, iMovie GarageBand et iWeb. Apple développe aussi sa propre suite bureautique iWork, en concurrence directe avec Microsoft Office dont elle reconnaît malgré tout les qualités.
Depuis son passage en 2006 à des Macintosh utilisant des processeurs Intel, il était devenu facilement possible d'installer Windows sur un Mac. D'abord interdisant l'installation de Windows sur ses Mac, Apple revient sur ses pas et propose dès 2006, Boot Camp, un logiciel qui facilite l'instalation de Windows en fournissant par exemple les pilotes nécessaires au bon fonctionnement de la machine. L'instalation de Windows sur les Mac devient alors l'un des arguments de vente des Macintosh.

Pour le marché des professionels, Apple propose également de nombreuses solutions logiciels. On trouve par exemple un version de Mac OS X dédiée aux serveurs, Mac OS X Server; WebObjects, XSan, un système de fichier pour réseau de stockage SAN etc. Pour le monde artistique professionnel on trouve Aperture dédié au traitement de photo-RAW, Final Cut Pro, une suite de production vidéo, Logic Pro un logiciel de MAO.

Au dela des logiciels présents sur les machines localement, Apple propose aussi des services en ligne avec MobileMe (anciennement .Mac) qui comprend des page web perso, un webmail, le service