Examen bactériologique des selles
par Catherine Dupeyron
Biologiste, Hôpital Albert-Chenevier, Créteil.
L'examen bactériologique des selles se fait par coproculture, c'est-à-dire par ensemencement des selles sur des milieux de culture appropriés. Le but est de rechercher parmi une flore commensale très abondante soit des bactéries habituellement absentes et réputées pour leur pouvoir pathogène, soit une espèce bactérienne anormalement prédominante.
Les indications de la coproculture sont triples :
- la recherche de la cause infectieuse d'une diarrhée, qui est la plus fréquente,
- le dépistage des porteurs sains pour les métiers de l'alimentation,
- les enquêtes épidémiologiques.
Dans le cas des diarrhées infectieuses, les bactéries à rechercher systématiquement sont Salmonella, Shigella, Campylobacter (et Yersinia dans les pays industrialisés).
Vibrio cholerae est le plus souvent recherché dans un contexte clinique particulier ou sur une demande spécifique. Les Escherichia coli pathogènes ne peuvent actuellement être totalement identifiés que dans des centres spécialisés (Instituts Pasteur). Clostridium difficile est recherché dans les diarrhées aiguës consécutives à une antibiothérapie importante.
1. Prélèvement
- Une noix de selles, dans un récipient stérile.
- Examen dans les 4 heures (conservation maximale 8 heures à 4°C).
2. Fiche de renseignements cliniques
Elle est demandée dans les pays industrialisés de façon à orienter judicieusement les recherches en fonction des renseignements suivants
- Âge.
- Signes cliniques : fièvre, douleurs, vomissements.
- Origine géographique ou voyage récent.
- Antibiothérapie.
- Cas de diarrhée dans l'entourage.
Elle est plus difficile à obtenir dans les pays en développement, mais une fiche même succincte est utile.
3. Examen macroscopique
- Noter l'aspect de la selle : purulent, présence de mucus, présence de sang.
- Sa consistance : liquide, molle, moulée.
4.