La relation double spécificitée structure moleculaire
On cherche à comprendre la spécificité enzymatique.
A partir d'exemples précis empruntés dans votre cours, vous montrerez que la double spécificité (ou les spécificités) des enzymes est liée à leur structure moléculaire.
( J'avoue m'être servi de vos schémas si durement produit mais, ils étaient si beaux que je n'ai pas pu résister... : )
INTRODUCTION.
Les enzymes accélèrent les réactions chimiques et sont intactes à la fin de la réaction. On dit qu'elles catalysent la réaction. Les enzymes étant des protéines, on parle alors de biocatalyseurs. Elles possèdent une double spécificité : spécificité d'action et de substrat.
Comment pourrait-on montrer que cette double spécificité est liée a la structure moléculaire des enzymes ?
Pour cela, il est nécessaire d'expliquer plusieurs relations :
D'abord il faudra démontrer que la structure spatiale est liée à la structure moléculaire. Ensuite il est indispensable de montrer que le site actif est tributaire de la structure spatiale de l'enzyme. Enfin il nécessaire d'expliquer que la double spécificité est directement dépendante du site actif.
I LA STRUCTURE DES ENZYMES
Tout d'abord, nous savons qu'une enzyme est une protéine. Elle est donc comme toute les protéines constituée d'un enchainement d'acides aminés formant des chaînes polypeptidiques. Ces acides aminés sont liés ente eux par des liaisons peptidiques. On cherche maintenant à savoir comment la structure moléculaire influence la structure spatiale. La structure spatiale se caractérise par le repliement de la chaine polypeptidique. Nous avons vu lors de l'exercice 9, que les ponts disulfures (liaisons) qui relient deux cystéines plus ou moins éloignés sur la chaîne imposent le repliement.
De plus, lorsque l'on modifie la structure moléculaire (dégradation des ponts disulfures) la structure spatiale est également modifiée En effet, lorsque il n'y a pas de liaison, la chaine de ribonucléase ne se replie quasiment pas.
Repliement