PHYLOGENIE MOLECULAIRE
HAFIDI ALAOUI Asmaa 17/07/2009

La phylogénie moléculaire est l'utilisation de la séquence des macromolécules biologiques pour obtenir des informations sur l'histoire évolutive des êtres vivants et notamment sur leurs liens de parentés, leur phylogénie. Le produit d'une analyse de phylogénie moléculaire est un arbre phylogénétique. Les macromolécules biologiques telles que l'ADN, l'ARN ou les protéines sont des composants fondamentaux de tous les êtres vivants. Ces molécules sont des polymères constitué de l'enchaînement de briques moléculaire de base dont la

succession constitue la séquence primaire. La parenté des êtres vivants considérés est reflétée par la similarité de ces séquences primaires. Jusqu'à une date assez récente, la séquence primaire des molécules biologiques n'était pas directement accessible. Cependant, au cours des dernières années, l'avènement de la PCR et du séquençage d'ADN ont permis un développement très important de cette approche, ce qui a eu pour conséquence de profondément remanier la vision traditionnelle de la classification des organismes. Malgré les problèmes qu'elle a pu rencontrer, la phylogénie moléculaire a ainsi permis de redonner un nouveau souffle à la science taxonomique en permettant de mieux comprendre l'évolution de certains traits morphologique des organismes. Ces arbres phylogénétiques représentent des arbres (au sens informatique du terme) qui montrent les relations de parentés entre les espèces (les feuilles de l’arbre) ou d’autres entités (des gènes, par exemple) supposées avoir un ancêtre commun (les noeuds de l’arbre). Mais ils ont plus qu’une utilité historique, avec plusieurs applications médicales : identifier les souches d’un virus, leur origine commune, ou encore, pour le VIH, la rapidité de ses mutations chez un malade pour déterminer si le traitement est efficace, Comprendre les liens entre espèces. On parlera donc souvent de taxons quand on évoquera les feuilles des arbres