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Avant la fin de l'année 2006, le groupe La Vie-Le Monde, majoritaire depuis 2005 dans le groupe Les Journaux du Midi (le Midi libre, L'Indépendant et Centre Presse) devait prendre le contrôle des quotidiens régionaux du Groupe Hachette-Filipacchi (Groupe Nice-matin, La Provence), à travers une holding commune avec la filiale du groupe Lagardère. La nouvelle entité serait alors propriétaire de tous les quotidiens régionaux du Sud-Est, de Perpignan jusqu'à Nice et la Corse. Ce projet ayant échoué courant 2007, les Journaux du Midi sont rachetés par le Groupe Sud-Ouest, tandis que les journaux du Sud-est sont entrés dans le giron du Groupe Hersant Média. En 2006, le groupe Monde a également revendu les Éditions Desclée de Brouwer à l'éditeur suisse Parole et Silence, spécialisé dans la spiritualité chrétienne.
En juillet 2007, Pierre Jeantet a succédé à Jean-Marie Colombani à la présidence du directoire1, avec Bruno Patino comme vice-président et Eric Fottorino comme directeur du quotidien Le Monde. Après sa démission du 19 décembre 2007, suite à des désaccords portant sur la gouvernance et la stratégie de développement avec la Société des rédacteurs du Monde, actionnaire de référence du groupe2, il a été remplacé par le directeur de la rédaction du Monde, Éric Fottorino, le 25 janvier 20083.
Fin 2008, il a cédé pour 3 à 4 millions d'euros la librairie religieuse La Procure, qui était sous le contrôle du groupe des Publications de la Vie catholique depuis 19754. En avril 2008, il a mis en vente la société éditrice des Cahiers du