cour de biochimie
1. Introduction.
A. La matière vivante.
C’est un assemblage de différents organites complexes permettant la reproduction (introuvable dans la matière inerte sauf les cristaux en solution qui croissent tout seuls) et la gestion de l’énergie
Il y a une dynamique d’échange entre les différents organites pour réguler l’ensemble du système. Cette coordination tend à la reproduction. Ces organites sont formés de macromolécules (protéines) constitués d’a-a. Ces macromolécules peuvent aussi être des polysaccharides donc formés de saccharides ou être des acides nucléiques formés de nucléo
a) Liaison covalente:
Deux atomes qui apporte chacun un électron de valence pour remplir sa dernière couche orbitale, polarisée ou symétrique.
El ou énergie de liaison est l’énergie nécessaire à la rupture de la liaison:
El= 300KJ/mol.
Rq: 1cal= 4,18J et 1J= 0,24cal.
b) Liaison non covalente:
-Liaison électrostatique (= saline= ionique): un atome va céder un électron à l’autre donc doublet sur le plus électronégatif.
Les ions sont rares à l’état isolés puisqu’ils s’empilent (réseau cristallin) en milieu solide, et s’associent à des molécules polaires telles que l’eau en milieu liquide.
El= 200 à 300KJ/mol.
-Liaison hydrogène: entre molécules polaires ou non. Il est plus fortement accroché au donneur.
Rq: Le donneur, l’accepteur et l’H doivent être alignés.
El= 30KJ/mol.
-Liaison de Van der Waals: force attractive non spécifique lorsque deux atomes sont à la distance d= 0,3 à 0,4nm. La distribution des électrons autour des atomes varie dans le temps d’où une possibilité d’attraction.
El= 10KJ/mol.
El faible mais elle devient significative lorsque de nombreux atomes sont en contact. Rq: Si P augmente, la force de Van der Waals augmente.
Complexité du vivant: si un polypeptide compte 200 a-a, il y a 10 séquences
200
possibles (car 20 ) c’est à dire >> au nombre d’atomes dans l’univers, qui est
130
d’environ 10 .
260