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Ces modifications sont contrôlées par les hormones comme l'adrénaline mais aussi par le système nerveux : des caméléons à qui on sectionne la partie inférieure de la moelle épinière ne changent plus de couleurs pour le bas du corps.
Translocation du pigment

Énormément d'espèces ont la capacité de faire migrer le pigment au sein des chromatophores, provoquant un changement de couleur. Ce procédé est en particulier étudié au sein des mélanophores, puisque la mélanine est le pigment le plus sombre et le plus visible. Chez la majorité des espèces possédant un derme assez fin, les mélanophores dermiques ont tendance à être plats ainsi qu'à couvrir une grande surface. Cependant, chez les animaux à derme assez épais, comme chez les reptiles adultes, les mélanophores dermiques forment fréquemment des structures tridimensionnelles avec d'autres chromatophores.
Ces structures (ou DCU pour Dermal Chromatophore Units) sont constituées d'une couche supérieure de xanthophores et/ou d'érythrophores, puis d'une couche d'iridophores, et enfin d'une couche de mélanophore en forme de panier avec des prolongements cytoplasmiques recouvrant les iridophores[12].

Dans les deux types de disposition, les mélanophores dermiques sont importants dans le changement de couleur physiologique.
Les mélanophores dermiques plats recouvrent fréquemment les autres chromatophores, ce qui explique que quand le pigment se répand dans la cellule, la peau apparait sombre. Quand le pigment est aggloméré au centre de la cellule, les pigments des autres chromatophores sont exposés à la lumière et la peau prend leur teinte.
De la même manière, après l'accumulation de la mélanine dans les DCUs, la peau apparaît verte de par le filtrage par les xanthophores (jaunes) de la lumière dispersée par la couche d'iridophores. Quand la mélanine se disperse, la lumière n'est plus décomposée; elle est absorbée par la mélanine et la peau apparait sombre.
Comme les autres chromatophores biochromatiques