Les acides aminés : structure, classification et propriétés

I- Définition

Acides aminés : molécules organiques associant une fonction acide et une fonction amine.
Il existe plus de 300 acides aminés soit à l’état libre, soit associés entre eux via des liaisons covalentes spécifiques (liaisons peptidiques) pour former des protéines.

1- Rôles

Les acides aminés remplissent dans les cellules des fonctions diverses :
- structurales : ce sont des monomères formant la structure primaire des protéines. Leur enchainement linéaire est impliqué dans la structure tridimensionnelle et la fonction des protéines.
- énergétique : l’hydrolyse d’1g de protides libère environ 4kcal (autant qu’1g de glucide) couvrant 15% de la production énergétique totale.
- métabolique : ce sont les précurseurs de molécules d’intérêt biologique majeur (hormones, neurotransmetteurs, acides nucléiques…)
- fonctionnelle : certains, à l’état libre, ont une activité biologique propre (ex : l’acide γ-aminobutyrique ou G.A.B.A)

2- Formule générale

L’acide aminé comporte :

- une fonction acide : le plus souvent carboxylique COOH
- une fonction amine : le plus souvent amine primaire NH2
- une chaîne latérale R : à l’origine des propriétés physico-chimiques)

Par convention et analogie avec la nomenclature des acides organiques, le Cα (C2 situé en α de la fonction la plus oxydée) porte la fonction acide carboxylique (la plus oxydée), la fonction amine, et la chaîne latérale. On parle d’ailleurs d’acide α-aminés.

NB : il existe des exceptions où la fonction amine n’est pas portée par le Cα (ex : β-alanine ou G.A.B.A)

II- Classification

- 20 acides aminés constitutifs des protéines
- Acides aminés issus de modifications post-traductionnelles des protéines.
- Acides aminés non constitutifs des protéines

A- Les acides aminés constitutifs des protéines
1- Classification a- Selon la structure chimique de la chaîne latérale R b- Classification basée