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Il est courant dans les médias d’utiliser « open source » et « free software » (logiciel libre) en tant que synonymes, ce qui n’est pas toujours vrai. Certes, on peut considérer qu’il s’agit de la même catégorie de logiciels, mais il existe des différences au niveau d’idées et de valeurs qu’il ne faut pas ignorer. Cette question ne présentait certainement pas de confusion vers le début des années 80, au lancement du mouvement du « logiciel libre » car l’ «open source » n’existait pas encore.
En effet, c’est le mouvement du logiciel libre qui est à l’origine de l’ « open source ». Les participants au projet GNU ( GNU’s Not UNIX), qui est le projet d’un système d’exploitation intégralement libre entamé par Richard STALLMAN le fondateur de la FSF, n’étaient pas tous d’accord avec la philosophie et les buts du mouvement du logiciel libre. En 1998, une partie de la communauté libre, qui ne croit pas aux idéaux du mouvement du logiciel libre, s’est donc mise à part et a commencé à faire compagne au nom de l’«open source ». Au départ, on utilisait «open source » au lieu de « logiciel libre » pour annihiler l’ambigüité que posait le terme « free » [Free software] qui signifie libre et gratuit au même temps, manière d’indiquer qu’un logiciel à un coût. Elle commence par la suite à renvoyer à un autre courant d’un discours qui ne défend pas la liberté aussi fortement que le mouvement du logiciel libre, et plus pragmatique.
La différence entre les deux communautés informatiques, ou entre toutes les autres, ne concerne pratiquement que les programmeurs, car derrière chaque mouvement il y a une philosophie, des idéaux à défendre, un style de développement et des contraintes légales. Donc, il est important pour les développeurs de maitriser la différence entre eux. Cependant, Les utilisateurs généralement ne s’intéressent pas au polémique entre « logiciel libre » et « open source » et n’éprouvent aucune sensation d’appartenance à un mouvement en utilisant