Le thème de la famille est présent dans Baby-sitter blues sous plusieurs formes.
La famille « naturelle » d’Emilien est quelque peu réduite : en effet il vit seul avec sa mère. Comme toutes les relations mère-fils, la leur est complexe et passe par tous les états : disputes, cris, ressentiments, mais aussi amour et soutien mutuel.
Emilien cherche une famille qui lui manque dans les personnages qu’il rencontre, notamment au cours de ses baby-sittings. Il s’invente tout d’abord une famille dont il serait fier : il serait le cousin de Martine-Marie et le neveu de M. Grumeaux. Puis il s’attache aux enfants qu’il garde comme s’ils faisaient partie de sa famille : il se considère comme leur grand-frère, surtout celui d’Anthony.
En réaction à son « manque de famille », Emilien veut aussi avoir une famille nombreuse.
Concernant les autres familles de l’histoire, on peut évoquer celle de Friquet, comme scindée en deux : la mère de Friquet s’occupe de sa petite sœur et le père a une relation plus proche avec Friquet. Enfin, un autre exemple montre qu’aucune famille n’est parfaite : celle des Durieux. Mme Durieux a eu son fils à 18