Dichroïsme circulaire

amphipatiques séparées par une boucle hydrophobe (voir figure ci-dessous). Dans cette étude, nous avons réalisé des mesures de dichroïsme circulaire, de fluorescence intrinsèque des tyrosines et de résonnance plasmonique de surface (SPR) afin de comprendre comment le domaine D2 permet l’interaction entre la protéine de capside et les phospholipides. Les mesures de dichroïsme circulaire sur un peptide synthétique N52G (N118-G171), correspondant au domaine D2, nous révèlent qu’il semble non structuré en

Applications : • • • – – – – – Optimisation géométrique Réactivité moléculaire Calcul de propriétés chimiques Énergie Densité électronique Orbitales atomiques et moléculaires Charges atomiques Moment dipolaire • • Propriétés RMN, IR Dichroïsme circulaire L1-PACES 1.3.2 Mécanique Moléculaire • • 1. Atome : boule indéformable chargée Liaison chimique : ressort O2 = O sp2 Affectation d’un type aux atomes : Npl = N sp2 N O N O C3 = C sp3 Car = C sp2 O2 = O sp2

d'analyse d'un alignement multiple Accessibilité au solvant Boger et al., 1986 Projection d'hélices SOPM - SOPMA Geourjon et Deléage 1994, 1995 Flexibilité Karplus et Schultz, 1985 Parker et al., 1986 Analyse de spectres de dichroïsme circulaire Antigenicité Codage type d'atomes type de résidus numero de la chaîne structure secondaire site fonctionnel Représentation sphères ombrées fil de fer chaîne principale chaîne latérale carbone alpha Sélection par atomes par résidus par

|* Préciser que l’ouverture des faisceaux est limitée par une ouverture |X | | | | | |circulaire (le diaphragme d’ouverture) ; considérée comme placée en F’obj. | | | | | | |* Définir l’ouverture numérique : O.N

hélice la plus représentée dans les protéines. On rencontre aussi des hélices 310 droite et des hélices π. Ces trois types d'hélices sont permises par le diagramme de Ramachandran. 2) l'hélice alpha étant active optiquement[3], les mesures de dichroïsme circulaire permettent de déterminer le "taux d'hélicité" d'une protéine en solution b. les acides nucléiques s'organisent en doubles hélices pour satisfaire les liaisons entre bases. Cette structure a pour effet de réaliser un empilement des bases les

colonne de nickel puis chromatographie d’exclusion de taille 205 3) Dosage des protéines par la méthode Bradford 206 I–5) Méthodes d’analyse des protéines GRA recombinantes 207 1) Etude de la structure secondaire des protéines recombinantes par dichroïsme circulaire 207 2) Etude de la dispersion des protéines recombinantes en solution par diffusion dynamique de la lumière 207 3) Etude des protéines recombinantes par microcopie électronique à transmission 207 4) SDS-PAGE et détection des protéines par coloration

propres et indépendantes. Les techniques de la biologie moléculaire permettent alors de cloner un domaine spécifique afin d’étudier une fonction donnée. Les techniques de la chimie analytique fine (diffusion de lumière, spectroscopie de masse, dichroïsme circulaire) sont maintenant appliquées aux macromolécules pour contrôler leur état en solution (agrégation, hétérogénéité de population en masse ou en charge, structures non repliées). Une modification des étapes de purification, voire de clonage et de

-4- La spectrométrie. est quantifiée, c'est-à-dire qu’elle ne peut prendre que certaines valeurs déterminées, appelées également niveaux d’énergie. - À chacune des valeurs possibles pour l’énergie d’un électron correspond une trajectoire circulaire stable, sur laquelle l’électron ne rayonne pas et ne perd donc pas d’énergie, et une distance noyau-électron. - Les changements d’énergie d’un électron ne peuvent s’effectuer que par sauts discontinus d’un niveau à un autre. On appelle ces

qui en fixent en moyenne 1,4 g / g (cette valeur est fonction de la température, de l’état réduit ou non, de la force ionique). La protéine devient alors un polyanion étiré dont la longueur est proportionnelle à sa masse moléculaire. Par dichroïsme circulaire il a été montré que des zones en α hélice existent encore dans la protéine traitée. Dans ces conditions la mobilité électrophorétique est alors proportionnelle à la masse moléculaire de la protéine quand le rapport charge / masse est le

HPr-Ser-46-P a été démontrée in vitro par des expériences de retard d’élution sur colonne (Deutscher et al., 1995). Ces résultats ont été confirmés par la suite par des expériences employant les techniques de résonance magnétique nucléaire et de dichroïsme circulaire (Jones et al., 1997). La spécificité de cette interaction a aussi été testée par retard d’élution sur colonne. En effet, alors qu’elle retarde l’élution d’HPr-Ser46-P, la présence de CcpA ne retarde pas celles d’HPr, d’HPr-His15-P et de HPr