Lysine décarboxylase

comporte de multiples copies de 3 enzymes différents et de 5 coenzymes: - Pyruvate décarboxylase : E1 auquel est lié le pyrophosphate de thiamine ou TPP. C’est un ester phosphorique de la thiamine (B1) . - C’est l’enzyme E2 qui est une dihydrolipoyle transacétylase (E2) dont le coenzyme est l’acide lipoïque. L’attachement de ce dernier à des chaines latérales de lysines de E2 produit des groupements lipoïles-lysine qui vont pouvoir transporter des groupements acétyles d’un site actif à l’autre

Test de LDC : Principe : Ce test permet de mettre en évidence les bactéries (lactose-) capable de produire la lysine décarboxylase. Les bactéries LDC+ ne produisent la LDC que dans un milieu acide car c’est une enzyme inductibles (c’est à dire produite que dans certaines conditions). Mode opératoire : Le milieu utilisé pour ce test doit contenir la lysine du glucose et un indicateur coloré dans ce cas le pourpre de Bromo crésol (jaune à pH acide et violet à pH neutre et alcalin)

différentiel des espèces appartenant aux familles des Enterobacteriaceae, Vibrionaceae et Pseudomonadaceae o LDC : : Détecte la présence de lysine décarboxylase, ce qui permet de faire un diagnostic différentiel des espèces appartenant aux familles des Enterobacteriaceae, Vibrionaceae et Pseudomonadaceae o ODC : Détecte la présence de l'ornithine décarboxylase, ce qui permet de faire un diagnostic différentiel des espèces appartenant aux familles des Enterobacteriaceae, Vibrionaceae et Pseudomonadaceae

bacille à Gram négatif * mobile (ciliature péritriche) *  aéro-anaérobie facultatif *  oxydase - * nitrate réductase + * fermentative du glucose * lactose - * H2S + (ou -) *  uréase - l * lysine décarboxylase + * utilisant la voie des acides mixtes * indole- * ne possédant pas la béta-galactosidase * à forte contagiosité, responsables de gastro-entérites, toxi-infections alimentaires et des fièvres typhoïde et paratyphoïde

On a l'habitude d'utiliser des abréviations à trois lettres ou à une lettre pour cette série de vingt aminoacides. Les animaux supérieurs sont incapables de biosynthétiser la totalité de ces aminoacides. Chez l'homme, l'isoleucine, la leucine, la lysine, la méthionine, la phénylalanine, la thréonine, le tryptophane et la valine doivent être apportés par la ration alimentaire, ils sont qualifiés d'indispensables. A ceux-ci, on peut ajouter des aminoacides essentiels que l'organisme synthétise à une

respectivement pour le pré-enrichissement, l'enrichissement et l'isolement de Shigella. La mise en évidence des caractères biochimiques des coliformes et de Shigella s'est faite sur les milieux du portoir réduit de Le Minor (Géloses Kligler-Hajna, Lysine-fer, Citrate de Simmons, Mannitol-mobilité et Urée-indole) ainsi qu’à l’aide de disques à ONPG (O-nitrophenyl-β, D galactoside). La gélose D-Coccosel à été utilisée pour le dénombrement des streptocoques fécaux. L’obtention de cultures pures des souches

Méthylations 00 2 9 10 0 2 I – Généralités: Importance à travers quelques exemples: (synthèse de composés méthylés). Bases méthylées (N6- Me-Adénine, 5-Me-cytosine, N7 -Me guanine) des acides nucléiques. Carnitine: dérivé triméthylé de la lysine hydroxylée (Me sur epsilon NH2) (transfert ag dans mitoch pour oxydation sous la forme d'acyl-carnitine, c’est à dire ester). Créatine (synthèse à partir d’Arginine qui libère guanidino acétate, qui sera méthylé): réserve énergétique créatine P dans

Lactose ONPG H2S Indole VP Citrate Urée LDC ODC Résultat + + - + - - - + + (+) : Caractère positif, (-) : Caractère négatif, V : Variable ; ONPG : Bêta galacto-D pyranoside, H2S : Hydrogène sulfuré, LDC : Lysine décarboxylase, ODC : Ornithine décarboxylase, VP : Réaction de Voges Proskauer pour la mise en évidence de la production d’acétoïne. Rôle Antigénique Chaque antigène, somatique O permet de définir un sérotype O correspondant, grâce à des réactions d’agglutination

homogénéisation, on incube les tubes de milieu d’enrichissement à 41,5°C pendant 18 à 24h.  Isolement On prélève une goutte des milieux d’enrichissement incubé et on pratique un isolement à la surface des boîtes de pétri contenant la gélose XLD (Xylose lysine désoxycholate). Incuber les boîtes à 37°C pendant 24 à 48h. Figure 8: Enrichissement dans Rappaport Figure 9:Isolement dans XLD Rapport de stage ouvrier au sein de laboratoire de l’ONSSA Agadir Faculté de sciences et techniques de Fès 13  Identification

déprotoné Acide Asp, D aspartique O β CH2 C OH β CH2 pKa = 3,9 H H + + O Glu, E Acide glutamique O γ CH2 C OH pKa = 4,1 H + O C O groupe amine protoné β CH2 ou déprotoné β CH2 γ CH2 δ CH2 ε CH2 :N :NH2 + Lysine Lys, K γ CH2 δ CH2 H + pKa = 10,5 H + ion alkylammonium ε CH2 + NH3 N groupe guanidine protoné β CH2 ou déprotoné β CH2 H + Arginine Arg, R γ CH2 δ CH2 N NH γ CH2 δ CH2 N NH pKa = 12,5 H N