Séquence biologique

Comparaison avec alignement des séquences d'ADN : cliquer sur traitement en sélectionnant toute les séquences et en mettant Beta en référence Beta Séquence d'ADN de référence longueur : 444 bases geneAlpha1.adn Séquence d'ADN longueur : 429 bases -> 291 bases différentes de la séquence de référence geneBeta.adn, geneDelta.adn Séquence d'ADN longueur : 444 bases -> 33 bases différentes de la séquence de référence geneBeta.adn, geneGammaA.adn Séquence d'ADN longueur : 444 bases

Module:bioinformatique La difference entre ‘’GENBANK’’,’’EMBL’’et ‘’DDBJ’’ Au cours des deux dernières décennies, alors que les progrès des biotechnologies conduisaient à une extraordinaire accumulation de résultats et de nouvelles données biologiques, dans le même temps, le développement de la science informatique permettait l'apparition de puissants systèmes de stockage, gestion et traitement de l'information ainsi que de protocoles de communication électronique permettant sa diffusion. L'automatisation

TP BIOINFO Dans ce TP nous voulons étudier une séquence inconnue résultante du séquençage d'un fragment d'ADN génomique humain. Pour cela, nous allons tout d'abord, chercher à prédire les gènes grâce à deux logiciels différents afin d'étudier la structure du gène. Puis, nous allons faire un alignement de séquence afin de voir si la protéine est connue. (….........................) I- Prédiction des gènes Dans cette partie, nous allons chercher à caractériser la structure exon-intron du

enzyme 6 fonctionnelle, l'adénine qui est incolore est synthétisée. Allèle f Ade2+ du gène présent sur le chromosome XV ② Ouvrir le fichier ade2.edi dans le logiciel ANAGENE : comparer les séquences nucléotidiques des allèles ADE2- et ADE2+ du gène ADE2 des deux souches de levures ainsi que les séquences peptidiques des enzymes 6 qu’ils codent. Les deux allèles ADE2 sont en tous points semblables exceptés au niveau du 103ème nucléotide : il s’agit d’un nucléotide de thymidine sur l’allèle 2

Qu'est-ce que l'ADN ? Structure Physico-chimique de l'ADN L'ADN (acide désoxyribonucléique) est une macromolécule biologique formée par deux chaînes complémentaires qui s'emboîtent tout en s'enroulant l'une autour de l'autre pour former une double hélice droite (Fig. 1). Chaque chaîne est constituée d'un squelette formé de phosphodiesters et de sucres (le ribose) en alternance. Chaque sucre porte en plus une "lettre" (un groupe chimique appelé "base azotée") du livre génétique; ces lettres

qui peuvent modifier la composition de l’ADN créant une nouvelle liaison entre deux thymines et forment un dimère. Sur le graphique on constate que la structure de l’ADN n’est pas le même chez les deux individus. L’individu normal comporte une séquence d’ADN normal tandis que l’individu alternatif à une nouvelle liaison de deux thymines. Ce qui créer un dimère et modifie l’asside amené qui a son tour créé un dysfonctionnement de la protéine. La protéine assurant le bon fonctionnement phénotype

l'autre qui migre moins vite et qui correspond à la forme circulaire non superenroulée. Une première lecture du gel montre donc qu'en présence de chaque enzyme, l'ADN plasmidique est coupé différemment. Cela suggère que chaque enzyme reconnaît une séquence nucléotidique spécifique. Estimation de la taille des fragments de restriction : exploitation quantitative de l'électrophorégramme Principe Le log décimal de la taille (en pb) d'un fragment linéaire peut être considéré comme

cellule identifie et corrige les dommages aux molécules. L’ADN se répare. L’apparition d’erreur au niveau des séquences nucléotidiques Des erreurs peuvent survenir au cours de la réplication mais aussi à d’autres moments du cycle cellulaire. Ces erreurs sont dues à des dégradations chimiques qui endommagent quotidiennement l’ADN et ont pour conséquence une modification de la séquence nucléotidique. Or la survie de l’individu ou de l’espèce (du moins à court terme pour l’espèce) exige que le matériel

Un gène est une séquence d'ADN, donc une séquence de nucléotides, portant une information responsable d'un caractère. Les chromosomes portent de nombreux gènes qui se succèdent sur leur molécule d'ADN: les individus d'une même espèce possèdent les mêmes gènes donc des caractères communs. Les mutations sont des modifications de la séquence des nucléotides d’un gène. Lorsqu'elles se produisent, on aboutit donc à une nouvelle version d’un gène appelée allèles. Les mutations peuvent être des

réguler le niveau de la transcription. Le fichier de séquence est dans l'ordinateur. © Que devez-vous rechercher au niveau de ces séquences? Nous allons étudier la structure de cet opéron afin de localiser les gènes et d'identifier les séquences nucléotidiques qui interviennent dans la régulation de leur expression. LES CADRES OUVERTS DE LECTURE: "ORF". Cette première approche est une analyse théorique. A partir de la séquence nucléotidique, on recherche: les cadres ouverts de