Rapport visite a une entreprise
L'Institut européen de bio-informatique (en anglais European Bioinformatics Institute, EBI) est une organisation à but non lucratif qui constitue une sous-division du Laboratoire européen de biologie moléculaire (European Molecular Biology Laboratory, EMBL). Il propose un certain nombre de bases de données d'acides nucléiques, de séquences protéiques et de structures macromoléculaires. Il est en quelque sorte le pendant européen du National Center for Biotechnology Information (NCBI) américain. Bases de données à l'EBI :
Les principales missions de l'European Bioinformatics Institute (EBI) centre sur la construction, l'entretien et la fourniture de bases de données biologiques et de services d'information pour appuyer le dépôt de données et d'exploitation.
1-Les séquences nucléotidiques : * ENA (European Archive nucléotides) - données primaires nucléotidiques, incorporant EMBL-Bank : A propos de l'European Archive Nucleotide:
Les Archives européenne nucléotides ( ENA ) saisit et présente des informations relatives aux flux de travail expérimentales qui sont basés autour de séquençage nucléotidique. Un flux de travail typique comprend l'isolement et la préparation du matériel pour le séquençage, une course d'une machine de séquençage dans lequel les données de séquençage sont produites et un pipeline bioinformatique analyse ultérieure. ENA enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre l'information d'entrée (échantillon, configuration expérimentale machine à la configuration,), les données de la machine de sortie (traces de séquence, les lectures et les scores de qualité) et de l'information interprété (assemblage, la cartographie, l'annotation fonctionnelle).
Les données arrivent à l'ENA à partir d'une variété de sources. Ceux-ci, par des données brutes, des séquences assemblées et d'annotation des efforts de séquençage à petite échelle, mise à disposition des données des grands centres de