Génétique de pop
Exercice 1 Dans les deux cas, on connaît la structure génotypique de la population (allèles codominants). Les fréquences alléliques se déduisent donc directement. Touts les autres statistiques sont calculé facilement. a) (i) Frequences alléliques : f(A1) = (A1A1+A1A2/2)/N = (125+31/2)/160 = 0.88 f(A2) = (A2A2+A1A2/2)/N = (4+31/2)/160 = 0.12 ou aussi f(A2) = 1–f(A1) (ii) Hétérozygotie observé : Ho = 31/160 = 0.194 (iii) Hétérozygotie attendue : He = 2pq = 2x0.88x0.12 = 0.21 b) (i) Fréquences alléliques : f(B1) = (B1B1+B1B2/2+B1B3/2)/N = (121+0/2+28/2)/160 = 0.84 f(B2) = (B2B2+B1B2/2+B2B3/2)/N = (2+0/2+1/2)/160 = 0.02 f(B3) = (B3B3+B1B3/2+B2B3/2)/N = (8+28/2+1/2)/160 = 0.14 ou aussi f(B3) = 1-(f(B1)+f(B2)) (ii) Hétérozygotie observé : Ho = (28 + 1)/160 = 0.181 (iii) Hétérozygotie attendue : He = 1 – (p2 + q2 + r2) = 1 – (0.706 + 0.0004 + 0.0196) = 0.274 Pour l’ensemble de loci : He = 0.24 Taux de polymorphism : P = 2/2 = 1 (100%) Diversité allélique : A = 5/2 = 2.5 Exercice 2 Même chose que précédemment: f(S) = (SSSSx4+SSSFx3+SSFFx2+SFFF)/(4xN) = (7x4+32x3+43x2+24)/(4x114) = 0,513 f(F) = 1-f(S) = 0,487 Exercice 3 a. f(C1) = 0.5376, f(C2) = 0.3271, f(C3) = 0.1353 b. Observed C1C1 43 C1C2 39 C1C3 18 C2C2 24 C2C3 0 C3C3 9 Total 133
Expected Chi-2
38.438 0.541
46.7707 1.29106
19.3534 0.0946
14.2274 6.7126
11.7744 11.7744
2.4361 17.686
133 38.1002
La valeur calculé de Chi-2 est plus grande que la valeur seuil de Chi-2 avec 3 (= 6 – 2 – 1) degrés de liberté et a = 0.05. Donc, la population n’est pas à l’équilibre de Hardy Weinburg. c) On utilise la formule pour F en fonction de H, ( He − Ho ) F= He Ho = f(C1C2) + f(C1C3) + f(C2C3) = 0.4286 He = 2p1 p 2 + 2 p 1 p 3 + p 2p3 = 0.3517 + 0.1455 + 0.0885 = 0.5857 F = 0.2683
Exercice 4 1) Il y a relation de dominance entre les deux allèles, on ne peut donc pas relier les génotypes aux phénotypes. Pour calculer les fréquences alléliques et