Génomique

prédire les substitutions à l’origine d’un changement de fonction et donc de guider les études expérimentales. Comme l’a si bien exprimé Dobzhansky (1900-1975), « rien n’a de sens en biologie, si ce n’est à la lumière de l’évolution ». l’heure où la génomique et la « postgénomique» produisent d’importantes quantités de données expérimentales, un des facteurs important reste leur analyse bioinformatique. . Nous allons tout d’abord nous intéresser, ici, à la phylogénie moléculaire, qui permet de retracer

l'ADN de cellules ou de tissus. L'ADN ainsi extrait peut ensuite être utilisé pour des recherches en biologie moléculaire, telles que le séquençage, la PCR ou le clonage. Différentes variantes sont employées, suivant que l'on cherche à extraire de l'ADN génomique (issu du ou des chromosomes des cellules analysées) ou de l'ADN plasmidique (provenant de plasmides portés le plus souvent par des cellules bactériennes  comme E coli).[9] 2. Etapes d’extraction Les principales étapes d’extraction sont :

relativement fréquentes ce qui rend d'ailleurs aussi sa multiplication in vitro assez délicate. Sur le terrain, l'observation de 15 descripteurs morphologiques en rapport avec les 2 espèces M. acuminata et M. balbisiana permet de préjuger la structuration génomique des variétés mais cette identification reste partielle car l'analyse génétique est parfois en contradiction avec l'observation in vivo. Elles sont ainsi classées en groupes selon leur constitution génétique et leur niveau de ploïdie, parfois en divisions

rapide, la réassociation est irréversible. La renaturation est seulement possible pour des petites molécules d’ADN. Les possibilités de renaturation sont utilisées pour faire de l’hybridation moléculaire pour étudier l’ADN humain : l’ADN cible (ADN génomique) est hybridé avec un ADN sonde (ADN de référence). L’augmentation des forces ioniques du milieu réactionnel (NaCl) permet une renaturation plus facile, les cations neutralisant les forces répulsives de l’ADN. 4) Le polymorphisme de l’ADN Les gènes

production de RL non neutralisés. Cible d’action de ces radicaux libres : niveau des phospholipides des membranes. Si les membranes se désintègrent : la cellule meurt, les débris cellulaires peuvent être phagocytés. Altération des séquences d’ADN génomique Altération ADN mitochondrial (exclusivement transmission maternelle) et dysfonctionnement des mitochondries. Mais balance RL et vieillissement cellulaire n’est pas si évident. D’autant que RL utiles notamment au cours diu développement, inflammation

transmises aux cellules filles, les cellules se multiplient alors de façon anarchique : c’est la première étape de la cancérisation. Le gène p53 est donc un anti-oncogène (anticancéreux). Le rayonnement ultraviolet crée des lésions sur l’ADN génomique mais il existe de nombreux facteurs prédisposant au cancer. Les facteurs de risque peuvent être endogènes et/ou exogènes. 4. Facteurs exogènes Ils sont aussi appelés facteurs environnementaux. Nous

Circadian clock‐coordinated hepatic lipid metabolism: only      transcriptional regulation?       Frédéric Gachon1, Xavier Bonnefont2      1    Department of Pharmacology and Toxicology, University of Lausanne, Lausanne, CH‐1005, Switzerland  2    CNRS, UMR 5203, Institut de Génomique Fonctionnelle, 34094 Montpellier, France    Running title: Rhythmic post‐transcriptional regulation of lipid metabolism Key words: Circadian clock, Lipid metabolism, Unfolded protein response, IRE1α, autophagy, growth hormone Correspondence: Frédéric Gachon

ouverte, développement des communications et développement exponentielle des nouvelles technologiques laissent penser à un nouveau cycle dans 50 ans ou moins. • Les prochaines innovations majeures ?  Biotechnologies (technologie du vivant)  Génomiques : OGM, clonage  Pharmacologie : médicamente génétiques  Nanotechnologies (1 nanomètre= 10-9 mètre)  Robotique : science qui étudie les systèmes électromécaniques actionnés et contrôlés par le biais d’un ensemble de logiciel leur conférant

développement des biopuces. En 2001, elles servaient à la découverte de nouvelles molécules. Entre 2002 et 2004, les biopuces étaient utilisées dans le diagnostic médical ou dans les essais cliniques comme les suivis thérapeutiques ou la toxico-génomique. Entre 2004 et 2008 elles permettent le typage de souches (VIH, hépatites) mais aussi le typage tumoral en établissant un profil génétique. A partir de 2010, la microbiologie et l’immunologie font appels aux biopuces. La thérapie personnalisé et

fondamentales : clone ; brassage génétique (combinaison d’allèles) inter- et intrachro- mosomique (crossing-over) au cours de la méiose ; diversité des gamètes ; stabilité des caryotypes ; distinction reproduction et sexualité ; diversification génomique. 15. Comment les transferts horizontaux et l’endosymbioses participent à la complexification des génomes ? Notions fondamentales : transferts génétiques horizontaux versus verticaux, endosymbiose, hérédité cytoplasmique, phylogénies. 16. Quels mécanismes