Séquençage de l'ADN

Chapitre 1 : LES BACTERIES. On a deux grands groupes, les archéobactéries et les eubactéries. La classification est basée sur des caractères génotypiques, sur la filiation évolutive (techniques de séquençage, types de parois, …). Par exemple, la paroi des archéobactéries ne renferme pas d’acide muramique qui est le composant typique des peptidoglycanes. Les lipides membranaires présentent des chaînes aliphatiques ramifiées, alors que chez les eubactéries, ces mêmes chaînes

en ADN complémentaire (ADNc) par une transcriptase inverse. 1. 1. Préparation d'une banque d'ADN à l'aide d'enzymes de restriction : banque d'ADN génomique. Préparation de l'ADN. Les enzymes de restriction (voir polycopié introduction au génie génétique) sont des nucléasse purifiées à partir de bactéries qui coupent l'ADN au niveau de séquences spécifiques de 4 à 8 nucléotides, produisant des fragments d'ADN de tailles strictement définies, les fragments de restriction. Les enzymes de restriction

suivant représente l’extraction d’ADN génomique à partir de sang. [pic] A. Dans le tube I, le guanidinium thiocyanate est communément utilisé pour la dénaturation des protéines. B. Dans le tube II, le culot obtenu après centrifugation contient l’ADN génomique. C. Dans le tube III, un tampon A à forte force ionique est appliqué sur la colonne de silice. D. Dans le tube IV, est ajoutée une solution B composée exclusivement d’éthanol pur. E. Dans le tube V, la solution C peut être de l’eau

peuvent donner naissances à des enfants malades, les parents sont donc hétérozygotes.b) le séquençage génétique familiale Le gène en cause a été identifié et séquencé en 1989. Situé sur le chromosome 7, il a été appelé CFTR en raison du rôle joué par la protéine qu’il code (Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator). Q vous disposez du séquençage de diverses personnes donc cette famille. Proposez une étude explicative, structurée, de

microsporidiennes : • Méthode de Weber • Coloration à Gram-chromotrope Analyses moléculaires : • Isolation de l’ADN • Caractérisation d’espèce par PCR • Analyse du polymorphisme par PCR • Electrophorèse sur gel de polyacrylamide et SSCA (=single stand conformation analysis) • Séquençage ADN Résultats  L’analyse de la présence de spores microsporidennes dans les fèces de pigeons a montré que : - Les selles

Clonage d’un fragment d’ADN de phage lambda dans un plasmide Pbluescript recombinant Email : Groupe 13 Résumer : Cet article à pour but de montrer comment cloner de l'ADN de phage λ avec comme vecteur un plasmide pbluescript. Nous avons pu voir au cour du TP comment utiliser les techniques de clonage moléculaire via un vecteur, la digestion enzymatique avec les enzyme EcoR1 et Hind III, la transgenèse par choc thermique, l'électrophorèse sur gel d'agarose, et la minipréparation a l'aide

Figure 3 Questions qui peuvent-être posée : 1) Qu’elle est la longueur du brin d’ADN ? 2) Combien le fragment de l’ADN digéré possède-t-il de sites de restrictions (coupures) pour les enzymes 1 et 2 ? 3) Utiliser les données de restrictions pour établir la carte de restriction. 1) C’est la somme des différents segments obtenus lors de l’une des simple digestion. Enzyme 1 = 8+6+3 =17 Kb 2) L’ADN est linéaire, donc : Enzyme 1-> on a 3 segments donc 2 sites de restrictions Enzyme 2-> On 2 segments donc

29/ E 30/ BCD 31/ AD 32/ AB 33/ CD 34/ AD 35/ BCD 36/ D 37/ CD 38/ B 39/ AD 40/ D QCM 1 : D A) Faux : Absence de groupement hydroxyle sur son carbone 2’. Si vous avez hésité, il faut vous rappeler sur le coup que les nucléotides qui forment l’ADN sont reliés par la liaison 3’-5’ phosphoester (entre le groupement phosphate en 5’ d’un nucléotide et le groupement hydroxyle en 3’ d’un autre nucléotide. Donc pas possible qu’il soit absent B) Faux : Il est appelé adénosine puisque c’est

(p32-33) p 49 cours photocopies - 32) navette malate aspartate http://www.chups.jussieu.fr/polys/biochimie/RMbioch/POLY.Chp.10.html - 33) navette DHAP et glycérol 3P http://www.chups.jussieu.fr/polys/biochimie/RMbioch/POLY.Chp.11.3.html -34) séquençage de l’ADN méthode enzymatique http://fr.wikipedia.org/wiki/S%C3%A9quen%C3%A7age_de_l%27ADN - 35) la réaction complète de la pyruvate déshydrogénase avec les enzymes qui interviennent dans la réaction p4 http://fr.wikipedia.org/wiki/Pyruvate_d%C3%A9shydrog%C3%A9nase

serait apparue sur Terre il y a au moins 2,5 milliards d'années. Les principaux caractères universels du vivant sont : -le carbone, qui de par ses caractéristiques physiques sert de "squelette" à tous les composés organiques. -l'ADN et l'ARN, qui servent de support au génome et assurent la transmission de ce dernier à la descendance lors de la reproduction. -la cellule qui est la plus petite unité vivante. Ce dernier point est discuté au sein de la communauté scientifique