Alignement de séquences

VERNISSE Mylène Groupe B2 Rapport de TP analyse de séquence Durant ce TP nous avons étudié une séquence résultant d'un fragment d'ADN génomique humain impliqué dans une maladie génétique, la phénylcétonurie. Pour cela nous avons utilisé plusieurs logiciels permettant d'analyser cette séquence tels que Genscan, Augustus, BLAST, KEGG. I – Prédiction de gènes Dans un premier temps, on utilise les logiciels Genscan et Augustus pour caractériser la structure exon-intron du gène étudié. Genscan est

côtes) représente la dénivelée Elle est égale : Soit à la différence des altitudes de ces deux points Soit à la différence des côtes de ces deux points Soit à la différence des lectures effectuées sur les mires placées sur ces deux points. Séquence/Thème Module Sq22 Topo Groupe CAP/STP Titre info Mise à jour Auteur Page Initiation Topo 28/09/11 R.C/L.D 1 sur 35 Le dessin topographique, architectural est un des moyens permettant d’informer ou de s’informer

hypothèse pour répondre à la problématique et concevoir un protocole expérimental qui permettrait de vérifier votre hypothèse. Vous disposez du matériel suivant : - Souche de levure Ade2, ces levures sont rouges mais deviennent blanches quand lors qu’une séquence (gène Ade2) d’ADN est mutée. - Boites de pétri stériles contenant un milieu de culture pour les levures - Matériel stérile de mise en culture des levures - Lampe UV et matériel de protection (blouse, lunettes, gants, charlotte, masque) 2. Réalisez

extrême, lorsque l'humidité est forte et que la salinité est faible,, l'ADN adopte la forme B, qui est la plus commune. On a également trouvé une troisième forme, la forme Z, dont les hélices tournent vers la gauche, que l'on retrouve en présence de la séquence CGCGCG. Cependant, comment ce long filament de bases azotées, de pentoses et de groupement phosphate détermine-t-il la structure primaire d'une protéine? C'est en fait l'ordre d'enchaînement des bases azotées qui dictent l'ordre d'enchaînement des

modification. For a native language (LM) and a spoken language (LP), pronunciation variants of the phones of LP are automatically extracted from an existing non native database. These variants are stored in a confusion matrix between phones of LP and sequences of phones of LM. This confusion concept deals with the problem of non existence of match between some LM and LP phones. The confusion matrix is then used to modify the acoustic models (HMMs) of LP phones by integrating corresponding LM phone models

présentant les séquences peptidiques des 3 opsines humaines. Fichier, Ouvrir,ops_homme_pro.edi (ou ops_ho 2.edi) Utiliser les fonctionnalités du logiciel Anagène pour comparer les 3 séquences peptidiques présentées (comparaison simple). Élaborer un tableau présentant les pourcentages de ressemblances des 3 séquences peptidiques présentées. Conclure en vous aidant du texte ci-dessous. « Il existe 20 acides aminés. Si ces 20 acides aminés étaient également utilisés dans les séquences protéiques,

Annotation d'un gène procaryote Vous allez rechercher les gènes présents sur les milles premiers nucléotides d'un contig du génome de Methanococcus maripaludis. Voici la séquence : >M.maripaludis CAGGGTTTAGGATATATTTCTAAAAAGAAAGCAAAACAGAAATTAAAAGAAGTAATTCAA GAAGTTATTTAATTTTTAAGTTTTTTTATTTTTTATTTGTTAAGTAATTAAATTAATTCA ACGAAGTTTTCAATCATTTTTAAACCGTTTTTACCACTTTTTTCAGGATGGAACTGGGTA GCATAAACGTTTTTTTTATTCAAAATGCACGGGAATTCGTAACCGTAATTAGTAGTTCCT GAAATTACGTCTTTTTCTGAAGGATTCACGTGGTATGAATGTACAAAGTAGAAATATTCA

Séquence 1 : GénétiqueChapitre 1 :Schéma mitose/méiose :• Monohybridisme : un croisement entre deux parents qui ne diffèrent que par la composition génétique d’un allèle. Ce croisement donne des monohybrides. Le monohybride est donc issu du croisement entre des parents avec différents allèles. L'hybride obtenu est de génération F1, F2.Ex : étude du monohybridisme chez les souris (transmission du gène déterminant la couleur du pelage)• Dihybridisme : un croisement entre deux parents de lignée pure

AUTOMATISATION DES PROCESSUS D’IDENTIFICATION DE SÉQUENCES D’ARN RIBOSOMIQUE 16S ET DE DÉTECTION DE CHIMÈRES Anne-Muriel Arigon1, Guy Perrière1 et Manolo Gouy1 1Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, UMR CNRS 5558, Université Claude Bernard – Lyon 1, 43 bd. du 11 Novembre 1918, 69622 Villeurbanne Cedex, France Les séquences d’ARN ribosomal (ARNr) 16S sont très fréquemment utilisées pour l’identification au niveau spécifique car il s’agit de molécules ubiquitaires, possédant une structure

faucille). L’hémoglobine est une grosse protéine formée de deux globines alpha (α) et de deux globines bêta (β). Elle transporte le dioxygène au sein du globule rouge. Chaque globine est une suite ou séquence d’acides aminés _ toutes les protéines sont des séquences d’acides aminés (il existe 20 acides aminés différents). Dans le cas de la drépanocytose, une modification de la globine bêta cause une agglutination des molécules d’hémoglobines en fibres microscopiques qui déforment