Génomique

l’intérieur des lymphocytes. • Transcription en ADN double brin, intégration de l’ADN viral dans le noyau de la cellule, transcription en de nombreux ARN messagers qui donneront de nombreuses transcriptases inverses, mais aussi en ARN viral génomique. • Assemblage des ARN et protéines virales dans de nouvelles particules qui bourgeonnent à la surface de la membrane plasmique du lymphocyte T4. • Libération des particules virales qui entraînent la mort de la cellule. Cette diminution

d’amplification PCR en détectant la fluorescence émise par les produits de PCR néo formés 4.3. Les applications de la PCR Diagnostic en virologie, parasitologie, bactériologie - Détection et quantification de microorganismes - Caractérisation génomique 

à Gram négatif (choc endotoxinique : activation du Complément et du système de la coagulation Contrôle génétique de la virulence • Gènes de virulence chromosomique ou plasmidiques • Souvent regroupés sous forme d’opérons dans des regions génomiques appelées « îlots de pathogénicité » (IDP) • IDP peuvent êtres transmis « en bloc » d’une souche à l’autre ; et même entre éspèces différentes Echappement aux défenses naturelles • Défenses naturelles antibactériennes : o Peau

suite à des erreurs de séquencage ou à cause des codons d'initiation alternatifs. De plus, BlastP n'est pas dédié à l'identification de la structure d'un gène. Le programme WISE est dédié à l'alignement d'une séquence protéique avec une séquence génomique. Il essaie de retrouver les zones de la séquence d'ADN qui codent pour la protéine. Comparez la séquence d'ADN entière aux protéines que vous avez mémorisées précédemment. Attention : il faut demander à faire la comparaison sur les deux brins de

appelé transgène, qui lui donne un avantage particulier, comme la résistance à des insectes nuisibles ou à des maladies, par exemple. On étudie le code génétique d'un organisme pour trouver le gène responsable de l'effet rechercher on appelle cela la génomique. Les raisons de leur développement: Les OGM ont été créé pour améliorer les propriétés de certains êtres vivants comme permettre a certaine plantes de résister contre certains organisme nuisible ou pour améliorer la productivité d'un produit se

sur 16 brins d'ADN, 8 ont la longueur définie Après 6 cycles : sur 128 brins d'ADN, 114 ont la longueur définie Nombre de molécules double brin d'une longueur définie (2n - 2n) X IGM La PCR IGM Réalisation d'une banque d'ADN génomique IGM Criblage d'une banque Criblage avec une sonde qui reconnaît l'ADN IGM Criblage d'une banque Notion de stringence IGM Criblage d'une banque Criblage avec une sonde qui reconnaît une protéine IGM Le Northern

Identifier le gène muté -dans le cas d’une mutation dominante: il faut construire 1) une banque d’ADN génomique à partir de chaque souche mutante, 2) transformer une souche sauvage et 3) cribler pour le phénotype attendu. Réisoler le plasmide d’intérêt et le séquencer. -dans le cas d’une mutation récessive: clonage par complémentation qui consiste à transformer la souche mutée avec une banque génomique et sélectionner les clones qui ont perdu le phénotype mutant. le plasmides est alors ré-isolé puis

diseases virus)  Hepatovirus, (espèce type : Hepatitis A virus) - Espèce : niveau le plus important, mais le plus difficile à définir, car besoin de critères :  Pas de reproduction sexuée => notion d’espèce basée sur l’analyse des séquences génomiques.  … mais pas de système de détection et de réparation des erreurs chez les virus à ARN => variations importantes entre souches d’une même espèce !!!  Notion empirique et subjective qui est le sujet de débats et de controverses. Exemple

chercheur en biologie est un scientifique de haut niveau qui étudie le vivant. Il est spécialisé dans un domaine comme l’embryologie, la botanique ou bien la génomique et s’intéresse à une thématique spécifique afin de produire de nouveaux savoirs qui contribuent aux progrès de la science (7). Si on prend comme exemple le domaine de la génomique, les travaux de recherche faits par le chercheur peuvent permettre aux médecins d’envisager de nouveaux traitements contre le cancer et d’élaborer des biomédicaments

certaines séquences de l'ADN). Ce phénomène a été découvert avec un ADN bactérien de Mycoplasma pirum (souvent associée au VIH). Il semble issu d'une résonance provoquée par le fond électromagnétique ambiant des ondes de très basse fréquence. L'ADN génomique de la plupart des bactéries pathogènes contient des séquences pouvant générer de tels signaux. Ceci pourrait conduire à développer des système de détection très sensible pour des infections bactériennes chroniques dans les maladies humaines et animales