Enzymologie en zymologie

744 mots 3 pages

Enzymologie
1- Généralités à propos des enzymes
a) Nature chimique et origine
Placement des atomes qui répond à un programme précis : le programme génétique x Enzyme= struct moléculaire retrouvée dans les struct spécialisée=> structure tertiaire -> confère une fonction Donc lien structure/fonction x Les enzymes sont des polypeptides ou protéines (et quelque fois des ARN = ribozymes) x Toutes les chaînes polypeptidiques des protéines sont élaborées à partir des mêmes 20 acides aminés
standards. …afficher plus de contenu…

x La modification de la composition chimique d’une chaine polypeptidique d’une protéine par modification de sa séquence en résidus d’acides aminés standards modifie sa structure primaire et sa structure tridimensionnelle.x Les versions modifiées d’une chaîne polypeptidique d’une protéine par remplacement d’un ou plusieurs résidus d’acides aminés sont appelés des « variants ». Cette modification est susceptible de modifier son …afficher plus de contenu…

-> grande spécificité des enzymes
Fischer : ce modèle permet d’interpréter la grande spécificité des enzymes mais pas son efficacité.
La serrure épouse la clé
Koshland : Ajustement induit : enzymes = struct flexibles des ajustements peuvent se faire pour rentrer

en relation

Rapport de laboratoire sur enzymes
2742 mots | 11 pages

Introduction Une enzyme est une macromolécule qui agit comme un catalyseur, soit un agent chimique qui augmente la vitesse d’une réaction sans être lui-même modifié au cours de cette réaction.1 Une enzyme est une protéine et possède donc une forme tridimensionnelle. Celle-ci permet à l’enzyme de lier par son site actif un substrat spécifique, par complémentarité. Dans une réaction impliquant une enzyme, la réaction est catalysée et, une fois terminée, le substrat est libéré. L’enzyme, qui n’intervient pas en tant que réactif, demeure inchangée et est prête à accueillir un nouveau substrat.….

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Orrection examen blanc de décembre 2007 - 1ère es
326 mots | 2 pages

*La mutation peut être sans conséquence : parce qu'elle est silencieuse (ADN changé mais séquence d'acides aminés de la protéine intact grâce à la redondance du code génétique) ou parce qu'elle est neutre : l'acide aminé changé ne modifie pas l'efficacité de la protéine. *La mutation peut être néfaste : parce que le ou les acides aminés changés provoquent une baisse de l'efficacité de la protéine. Ainsi, les mutations modifient parfois le phénotype moléculaire ce qui pourra modifier le phénotype cellulaire et aura parfois pour conséquence un changement dans le phénotype….

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SVT : l'ADN
679 mots | 3 pages

TP5 l’expression de l’ADN : la Transcription I/ Un gène, une protéine Une protéine : Une protéine est un enchainement d'acides aminés. Elle peut être une enzyme qui permet de réaliser les réactions métaboliques ou des transporteur (hémoglobine) ou encore servir dans la structure d'un élément (kératine). Séquence d’acides aminés de l’hémoglobine normale et drépanocytaire et les extraits de la séquence nucléotidique du gène codant ces 2 protéines….

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TP 2 Site actif d une enzyme
421 mots | 2 pages

En utilisant l’éditeur de commandes (le petit carrée avec les lettres ABC), sélectionner les acides aminés n°197, 300, 233 (en tapant juste le numéro de l’Aa dans la barre de commandes) ; sélectionner ce choix dans la fenêtre « sélection des atomes » puis les afficher en sphère de couleur distincte (chaque Aa d’une couleur différente). Réaliser une capture écran puis réaliser un document légendé et titré du complexe enzyme-substrat dans un traitement de texte ou d’image de votre choix Discuter de la position de ces Aa et de leur fonction dans la réaction d’hydrolyse de l’amidon Mode opératoire N°3 : Localisation des Aa du site actif chez l’amylase mutée Ouvrir le fichier de l’amylase mutée. Procéder de la même façon que dans le mode opératoire N°2….

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Le génothype ne svt
806 mots | 4 pages

Les propriétés des protéines dépendent de leur séquence respective en acides aminés. 2-2-Le code génétique : principe et utilisation du tableau des correspondances codon-acide aminé. 2-3-Les protéines, en régissant la structure et les activités cellulaires, contribuent à l'établissement du phénotype. 2-4-Universalité du code génétique et possibilité de modification du phénotype par transgénèse La modification du génotype d'un organisme par transgénèse, qui permet de produire de nouvelles protéines, repose sur l'universalité du code génétique. 3-Complexité des relations entre génotype et phénotype - Applications 3-1-Effets d’une mutation aux différents niveaux d’organisation (de l’organisme à la molécule).….

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COPAG
5198 mots | 21 pages

Apprendre à déterminer pour chaque coenzyme les sous –classes d’enzymes pour lesquelles il peut servir de cofacteur. Connaître les principaux coenzymes notamment les couples NADH,H+/NAD+ NADPH,H+/NADP+ FADH2/FAD impliques dans les réactions de transport d’hydrogène et d’électrons, les sites réactionnels et leurs modes d’action. Connaître la séquence de réactions d’oxydation du pyruvate en acétyl-CoA, la composition du complexe multi-enzymatique, l’ordre d’intervention des coenzymes impliqués. Connaître la formule semi-dévelopée du pyruvate et de l’acétyl-CoA. 2 PLAN OBJECTIFS 1 - INTRODUCTION - PROPRIETES 2 - LES COENZYMES D'OXYDOREDUCTION 2.1 - COENZYMES NICOTINIQUES OU PYRIDINIQUES 2.1.1 – PROPRIETES ET STRUCTURE 2.1.4 – MECANISME DE FORMATION DU COMPLEXE ENZYMATIQUE ET DE LA CATALYSE 2.2 - LES COENZYMES FLAVINIQUES 2.2.1 – PROPRIETES ET STRUCTURE 2.2.2 – MECANISME D’ACTION 2.2.3 – PRINCIPALES FLAVOPROTEINES MEMBRANAIRES 2.3 - LES COENZYMES QUINONIQUES : UBIQUINONE ET PLASTOQUINON²E 2.4 - LES METALLOPORPHYRINES : CYTOCHROMES ET PEROXYDASES 2.4.1 - CYTOCHROMES 2.4.2 – CATALASES ET PEROXYDASES 2.4.3 - OXYGENASES 2.5 - PROTEINES FER-SOUFRE 3 - LES COENZYMES DE TRANSPORT DES RADICAUX MONOCARBONES….

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Enzymologie Version du 08 09 2014
2140 mots | 9 pages

Les enzymes sont des protéines ou parfois des ARNr (ribozymes) Ils jouent le rôle de catalyseurs biologiques : les enzymes accélèrent les réactions chimiques dans les systèmes biologiques d'un facteur supérieur à 106. Exemples : OMP decarboxylase : 1017 Nucléase staphylococcique : 1014 Anhydrase carbonique : 106 Les enzymes sont hautement spécifiques de la réaction catalysée et du substrat transformé. Cette spécificité est toutefois relative : Exemples : enzymes protéolytiques subtilisine (origine bactérienne) : liaison X-X trypsine :….

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Les acides aminés
963 mots | 4 pages

2- Formule générale L’acide aminé comporte : - une fonction acide : le plus souvent carboxylique COOH - une fonction amine : le plus souvent amine primaire NH2 - une chaîne latérale R : à l’origine des propriétés physico-chimiques) Par convention et analogie avec la nomenclature des acides organiques, le Cα (C2 situé en α de la fonction la plus oxydée) porte la fonction acide carboxylique (la plus oxydée), la fonction amine, et la chaîne latérale. On parle d’ailleurs d’acide α-aminés. NB : il existe des exceptions où la fonction amine n’est pas portée par le Cα (ex : β-alanine ou G.A.B.A) II-….

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Support enzymo 1
1511 mots | 7 pages

Enzymologie I – Catalyse enzymatique 1 - Définition de la catalyse Afin de permettre la réalisation de certaines réactions chimiques, il faut parfois ajouter un composé qui, sans prendre part à la réaction, va faciliter le déroulement des processus chimiques : ce composé facilitateur est un catalyseur chimique. Définition d’un catalyseur selon Ostwal (1902) : « Substance accélérant la vitesse d’une réaction chimique sans apparaître dans les produits finaux. » Modèle de la serrure et de la clé pour modéliser l’interaction des substrats et des enzymes : le site actif a normalement la forme complémentaire de celle du substrat. Modèle de l’adaptation induite pour l’interaction des substrats et des enzymes : l’enzyme change de forme lors de sa liaison avec le substrat. Les formes ne sont complémentaires qu’après la fixation du substrat.….

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Svt- du genotype au phenotype
462 mots | 2 pages

La séquence des nucléotides dans l'ADN gouverne la séquence des acides aminés dans la protéine selon un système de correspondance, le code génétique. Les propriétés des protéines dépendent de leur séquence respective en acides aminés. Ces protéines, en régissant la structure et les activités cellulaires, contribuent à l'établissement du phénotype. Limites : seuls sont traités les exemples permettant l'acquisition des notions d'échelle….

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Cour svt
512 mots | 3 pages

Les protéines sont constituées d’un enchaînement d’acides aminés. Les propriétés des protéines dépendent de leur séquence en acides aminés. Les protéines contribuent à l’établissement du phénotype. . Des modifications (mutations) de la séquence de nucléotides d’un gène sont à l’origine de nombreuses versions de ce gène : les allèles.….

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La synthèse des protéines
761 mots | 4 pages

Chapitre 3 : La synthèse des protéines Introduction : Une protéine est déterminée par sa séquence en acide aminé Problèmes : Comment les protéines sont-elles synthétisées (fabriqué) ? Grâce à quoi ? Qu’est qui détermine la séquence ? I)….

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Bio cell
926 mots | 4 pages

14/11/12 BIO CELLULAIRE Structure primaire de la protéine –> forme qu'elle prend, ordre que prennent les acides aminés Les protéine sont des molécules très variés Si on assemblait au hasard 129 acides aminés pigés au hasard parmis les 20, il y aurais une chance sur 20^129 d'obtenir une protéine spécifique La protéine assemblée se replie pour former une structure tridimensionnelle précise : La nature des liaison influe sur les niveau de stabilité ⁃ Liaison ionique ⁃ Liaison hydrogène : plus la protéine est longue on vas d'autant plus retrouver ces liaisons, plus costaud, assez facilement cassée pour modifier la structure de la protéine. ⁃ effet hydrophobe : faible, l'eau ne peut pas s'y insérer ⁃ point disulfure :pas très nombreuses liaison les plus rigide, permet de maintenir un forme….

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Dissertation
4593 mots | 19 pages

D’autres facteurs que la nature propre d’une enzyme peuvent avoir une influence sur la vitesse enzymatique. Toute modification de structure de la molécule modifie l’activité, enzymatique La participation des enzymes à la réalisation du phénotype B Sommaire séquence 1 – SN12 9 © Cned – Académie en ligne La diversité des phénotypes ; Les enzymes N A ous allons dans cette séquence nous intéresser d’une part à la diversité des phénotypes et d’autre part aux molécules des cellules qui jouent un rôle déterminant dans la réalisation de ces phénotypes : les enzymes.….

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La protéine
299 mots | 2 pages

Une protéine est une macromolécule biologique composée d’une ou plusieurs chaînes d'acides aminés liés entre elles par des liaisons peptidiques (chaine polypeptidique). En général, on parle de protéine lorsque la chaîne contient un grand nombre d’acides aminés, et de peptide pour des assemblages de petite taille. L'ordre dans lequel les acides aminés s'enchaînent est codé par le génome et constitue la structure primaire de la protéine. La protéine se replie sur elle-même pour former des structures secondaires, dont les plus importantes quantitativement sont l'hélice alpha….

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