Génomique

1 SNP tous les 300 pb). Les SNPs sont référencés dans la base de données dbSNP (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/). ● Les CNVs (Copy Number Variations): Il s’agit de variation du nombre d’exemplaires contigus de grands segments génomiques (perte ou gain de fragments de quelques kb à plusieurs Mb). A ce jour, des CNVs ont été identifiés dans environ 15% du génome humain. Les CNVs sont référencés dans la base de données Database for Genomic Variants : (http://projects.tcag.ca/variation/)

B-L’hybridation permet le repérage d’une séquence d’ADN Digestion par enzyme de restriction ADN génomique extrait Fragments d’ADN Électrophorèse Séparation par taille Hybridation avec sonde sb marquée Choix température * Transfert sur membrane Par capillarité Dénaturation par NaOH Fixation Lavage autoradiographie b-les autres types d’hybridation Hybridation de colonies bactériennes Puces à ADN L’ARN peut aussi être hybridé : northern blot L’hybridation sur puce pour

‐ 
Autres
diverses

 
 
 
 
3000
molécules
médicamenteuses

 
pour
seulement
1000
cibles
moléculaires
 
validées.
 Génomique – Protéomique Métabolomique Génome ADN (environ 30 000 gènes) transcription Transcriptome ARNm traduction protéines Protéome modifications posttraductionelles protéines fonctionnelles (>100 000) Métabolome métabolites N cibles potentielles à valider ? Génomique
du
génome
humain
 et
protéomique
:

 
entre
10000
à
30000
cibles
poten3elles.
 pas
toutes
d’intérêt
pharmacologique
et
pas
forcément


CHEVRET Fécondation UE2 PACES 2011-2012 ( it ) (suite) IV Les anomalies de la fécondation IV. V. Les anomalies p par excès de génome g VI. Les conséquences de la fécondation 1 La 1. L reconstitution stit ti de d lla ploïdie l ïdi 2. L’empreinte génomique 3 L’inactivation 3. L inactivation de ll’X X Dr E. CHEVRET Fécondation UE2 PACES 2011-2012 Spermatozoïde fécondation Ovocyte II Zygote yg Cellule diploïde Gamètes haploïdes Dr E. CHEVRET Fécondation UE2 PACES 2011-2012 La période de fécondabilité

fonctionnalité d’un gène M d’une bactérie. Pour cela, on essaie de cloner au site Eco RI du vecteur plasmidique pBR330 (voir schéma) un fragment Eco RI-Eco RI d'ADN génomique de la bactérie d’intérêt : a- Proposez un protocole de clonage et indiquez comment vous sélectionnez les clones recombinants. ! Préparation de l'insert: Extraction d'ADN génomique de la bactérie. Digestion partielle de cet ADN par l'enzyme de restriction Eco RI, de manière à générer des fragments de 5 à 10 kb. Electrophorèse préparative

industrielle, dans la perspective de valorisation des travaux de recherche et les résultats obtenus dans le cadre du programme de génomique végétale Génoplante®. Activité GENOPLANTE VALOR est une société créée pour gérer la propriété intellectuelle et valoriser les résultats issus du programme de génomique végétale Génoplante. Génoplante est le programme fédérateur de recherche en génomique végétale en France. Soutenu par l’ANR, il réunit des partenaires aussi bien issus du public que du privé (INRA, CNRS,

et Pseudomonas............................... ...... 46 1 2. Techniques de biologie moléculaire.................................................................... 47 A. Préparation d’ADN génomique de Mycobacterium sp. 6PY1..................... ...... 47 B. Construction d’une banque d’ADN génomique de Mycobacterium sp. 6PY1... 47 C. Amplification in vitro de fragments d’ADN (PCR)........................................... 48 1. Mode opératoire...............................................

plasmide en utilisant un marqueur génétique comme un gène conférant une résistance à un antibiotique. Les étapes de la miniprep consistent à lyser les cellules par un détergent en milieu alcalin (SDS-NaOH) afin de libérer l'ADN génomique et plasmidique. L'ADN génomique et les protéines sont précipitées par de l'acétate de sodium. Le précipité est séparé par centrifugation, le surnageant contient l'ADN plasmidique. Celui-ci est précipité par de l'éthanol à 95 % et lavé par de l'éthanol à 70 % pour

phylogénétique des phytoplasmes en utilisant la méthode PAUP. Plusieurs groupes ont ainsi été caractérisés. De grands progrès concernant la sensibilité et la spécificité des méthodes de diagnostic résultent de la connaissance des ADN ribosomique et génomique et des antigènes. On dispose désormais d’une panoplie de techniques qu’il convient d’adapter aux fins recherchées, inventaire ou épidémiologie et à la teneur en phytoplasmes des espèces végétales à Liste des abréviations. AAY ou Ay-Mi : aster

Projet Recherche Innovation De la génomique à la protéomique, les apports des sciences FONDAMENTALES DANS L’INNOVATION PHARMACEUTIQUE QUELS SONT LES ENJEUX ECONOMIQUES DES SCIENCES FONDAMENTALES ET DES BIOTECHNOLOGIES DANS L’INNOVATION PHARMACEUTIQUE ? Résumé : Face à de nouvelles exigences conduisant à une nouvelle configuration du marché, le secteur du médicament est en recherche d’un nouveau modèle. Ainsi pour contourner les difficultés, l’industrie pharmaceutique se doit de mettre