Liaison peptidique

un rôle, la petite sous unité va faire correspondre les ARNt qui portent les acides aminés au codon de l’ARNm et la grosse sous unité va catalyser la formation de liaisons peptidiques qui vont reliées ensemble les acides aminés on parle de l’activité peptidyl-transférase de la grande sous unité. Le principe de cette liaison peptidique repose sur l’élimination d’une molécule d’eau entre le groupement COOH d’un acide aminé et le groupement NH2 de son acide aminé voisin. Terminaison : présence d’un

PRINCIPE L’hydrolyse acide va nous permettre grâce à l’ajout d’acide chlorhydrique (HCl à 12M) à hydrolyser la liaison peptidique - HCl → H++ Cl- . Les ions H+ vont réagir avec l’eau, ce qui va donner - H++H2O→H3O+ Alors que les ions Cl- vont tout simplement acidifier le milieu. D’un point de vue thermodynamique, nous allons apporter de l’énergie pour rompre la liaison peptidique afin de connaître la structure du dipeptide. Ce composé dégrade certains acides aminés lors de l’hydrolyse. Le

. . . . . . 26 4.1. 4.1.1. LA LIAISON PEPTIDIQUE ......................................................................................................... 27 Type de liaison................................................................................................................ 27 _______________________________________________________________________________ Licence STE – Biochimie 1 : Les protéines 4.1.2. 4.2. LES CHAÎNES PEPTIDIQUES ET LEUR NOMENCLATURE ..............

protéines du bol alimentaire en hydrolysant les liaisons peptidiques auprès des acides aminés aromatiques qu'elles savent reconnaître. Les acides animés aromatiques sont des maillons qui constituent les protéines. Celles-ci sont reliées par des liaisons covalentes et sont stables lorsqu'elles sont liées. Si le nombre d'acides animés est inférieur à 20, on parle de peptide, si leur nombre est supérieur à 100, on parle alors de polypeptide. (Liaison peptidique, source de l'image: wikipédia)

auquel sont liés : * un groupement amine (NH2), un groupement COOH et une portion variable d’un AA à l’autre = radical. - Dans une protéine, le groupe carboxyle d’un AA est lié au groupe aminé de l’AA suivant. III- Structure primaire : liaison peptidique entre ≠ AA. - H3N+---AA1---AA2---AA3---AAn---COO- LA SYNTHESE DES PROTEÏNES: I- Définition du code génétique: - C’est la loi de correspondance entre la séquence en nucléotide de l’ADN ou de l’ARN et la séquence en AA du polypeptide correspondant

AUG sur l’ARNm 3. Par complémentarité entre les codons AUG et l’anticodon de l’ARNt-met 4. Lors de l’élongation, l’arrivée successive des ARNt se fait sur les différents codons de l’ARNm 5. Le ribosome catalyse la formation d’une liaison peptidique entre l’a.a entre l’extrémité du polypeptide en cours de formation 6. Le déplacement ou translocation des ARNt 7. Nécessite l’énergie de l’hydrolyse du GTP en GDP+Pi 8. Le cycle de l’arrivée successive des ARNt se continue jusqu’au

pH normal du corps humain est de 7, à d’autre pH la catalase risque fortement d’être dénaturé. Pour la section F1, l’activité enzymatique de la catalase sera diminuée ou même annulée puisque la trypsine est une enzyme capable de couper les liaisons peptidiques de la catalase. Pour la section G1, nous pensions qu’il ne ce passerait rien puisque la catalase est dénaturé et ne peut donc plus participer dans la réaction. MANIPULATIONS : Pour les manipulations, nous avons suivit le protocole

différent. Les peptides I-Les liaisons peptidique Liaison Amides Chaine polypeptidique Nomenclature liaison isopeptidique Peptide cyclique II Determination des sequence ppt I-liaisons peptidique -Liaisons amide Les aa sont liée les uns les autres par une réaction de condensation entre la fonction COOH etla fonction Nh2. (Liaison très stable, qui peut durée 1000 ans) Géométrie de la liaisons Doublet de N qui rente en liaison avec le groupement carbonyle, présence

L'anticodon d'un autre ARNt vient se fixer au codon complémentaire de l'ARNm situé à coté de l'ARNt d'initiation. Ce nouvel ARNt va se fixer au site A du ribosome . 4 Un composant de la grande sous unité ribosomale va catalyser la formation d'une liaison peptidique entre les 2 aa des ARNt. La méthionine va alors se détacher de son ARNt du site P et reste attaché à l'aa du site A . 5 L'ARNt du site P se détache alors du ribosome et celui-ci se déplace vers la droite pour faire avancer le brin d'ARNm

acide 30aminés peut être présent plusieurs fois et tous les acides aminés ne sont pas nécessairement présents. Un enchaînement linéaire d’acides aminés s’appelle une chaîne polypeptidique. Chaque acide aminé est relié au suivant par une liaison appelée liaison peptidique. L’enchaînement ordonné 35et linéaire des acides aminés à l’origine de la structure spatiale de la protéine (repliement dans l’espace de la chaîne polypeptidique). Ce repliement donne sa fonctionnalité à la protéine 40 3. Lecture de