Séquençage

 — LES TECHNOLOGIES DE LABORATOIRE - N°5 Juillet-Août 2007 Article de synthèse Évolution des techniques de séquençage EL FAHIME Elmostafa1 and Ennaji Mly Mustapha2 1* Unités d’Appui Technique à la Recherche Scientifique UATRS, Plateforme Biologie moléculaire et Génomique Fonctionelle, CNRST, RABAT elfahime@cnrst.ma 2* Laboratoire de Virologie, Hygiène et Microbiologie, FST Mohammadia, Université Hassan II - Mohammadia. Résumé: La biologie analytique a connu depuis quelques années une grande

que ceux de la bio-informatique ont permis le séquençage des 3 milliards de paires de nucléotides réparties sur les 46 chromosomes du génome humain. L’étude des génomes humains a révélé que 1,5% du génome code les 20 000 gènes (portions codantes de l’ADN) environ qui ont été identifiés et que plus de 50% de l’ADN n’a pas actuellement de fonction connue. Les séquençages montrent que les humains sont génétiquement très peu diversifiés

Séquençage PROTOCOLE INITIAL 4 mélanges sont préparés: - le fragment qui doit être séquencé - un petit morceau d'ADN dont la séquence est complémentaire à l'extrémité 3' du fragment à séquencer = amorce - les 4 dNTP's (dCTP, dATP, dGTP, dTTP) - l'ADN polymérase (vecteur) PRINCIPE : Technique de Sanger Pour le séquençage des nucléotides légèrement différents sont utilisés: les didésoxyribonucléotides (ddNTP) au lieu des désoxyribonucléotides triphosphate (dNTP). PROTOCOLE INITIAL

SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION D’UN PANEL DE GÈNES POUR L’ANALYSE EN GÉNÉTIQUE SOMATIQUE /Validation de la méthode MARS 2016 O UT IL S PO UR L A PR AT IQ UE1 SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION D’UN PANEL DE GÈNES POUR L’ANALYSE EN GÉNÉTIQUE SOMATIQUE /VALIDATION DE MÉTHODE Dans le cadre de la réforme de la biologie médicale, tous les laboratoires des plateformes de génétique moléculaire devront être partiellement accrédités selon la norme ISO 15189 par le Comité français

et de séquences non-codantes. Il y a plusieurs gènes sur un même chromosome. I – Séquencer et comparer des génomes Séquence: succession ordonnée de nucléotides Comment la séquence du premier génome humain a-t-elle été déterminée? IA – Le séquençage du génome humain Principe de test de paternité Source: gnis-pedagogie.org La méthode de l’électrophorèse L’électrophorèse est une technique séparative. Elle consiste à soumettre un mélange de molécules à un champ électrique, ce qui entraîne

étapes : 11 Chronologie sur le séquençage de l'ADN 1er gène ARN par W. Fiers et al. 1972 Technique de Maxam-Gilbert pour l'ADN 1975 1977 1ère bactérie H. influenzae 1,83 Mb 1977 1er pluricellulaire C. elegans 100 Mb 1996 1er eucaryote S. cerevisiae 12 Mb 1987 1er virus phi X174 par Sanger et al. Technique de F. Sanger et al. pour l'ADN 1995 1er séquenceur Applied Biosystems 1998 Séquençage massif et parallèle 2001 2008

Chapitre 04 : l’histoire humaine lue dans son génome I/ Des techniques au profit de la connaissance des génomes actuels et passés (unité01)Le séquençage du génome humain, c’est-à-dire la détermination de la totalité de la séquence de nucléotides du génome humain (soit 3,4 milliards de pdb), a été réalisé entre 1990 et 2003. Il a permis de déterminer les 25000 gènes humains (selon les dernières données) et leur localisation sur les chromosomes. Ce travail a aussi permis de révéler qu’une partie importante

L’INDUSTRIE DES SÉQUENCEURS D’HIER ET D’AUJOURD’HUI La recherche a connu depuis quelques années une grande révolution en conséquence des progrès technologiques de la biologie moléculaire appliquée au séquençage des génomes. En effet, connaître l’enchaînement complet des bases nucléotidiques qui constituent un génome, c’est connaître toute l’information nécessaire à la vie (du moins en théorie). Ce n’est que récemment, avec la mise en place des Programmes Génome, que de nombreux génomes, dont

Thierno Sow 28 novembre 2012 Laboratoire : Séquençage d’ADN et étude phylogénique But Déterminer la séquence de Drosophila melanogaster et la comparé aux 4 autres séquences de Drosophila arizonae, Drosophila mettleri, Drosophila mojavensis et Drosophila nigrospiracula afin de déterminer les mutations

taxonomie reposait principalement sur des caractères phénotypiques. Aujourd’hui, la chimiotaxonomie (ou taxonomie moléculaire) fait appel à l’analyse moléculaire et utilise entre autre des critères génétiques (hybridation ADN-ADN, séquençage des ARNr 16S, séquençage de divers gènes...) L’absence de définition précise des différents rangs taxonomiques est un obstacle à l’élaboration d’une classification officielle universelle. LES RANGS TAXINOMIQUES BACTERIENS ET LEURS NOMENCLATURES 1.1