Transférase

Monographs 84: 1–186. Les travaux que vous allez réaliser en TP portent sur l’étude d’un rétro-transposon de tomate. Ce rétro-transposon a été identifié suite au clonage de la région promotrice du gène SlEZ2 (gène codant pour une histone-methyl-transférase), réalisé en utilisant l’ADN génomique de la tomate cultivée (très proche de l’espèce S. lycopersicum var cerasiforme). Vous avez deux objectifs : Le premier est d’analyser la présence ou l’absence de ce retro-transposon au locus SlEZ2 chez différentes

fucose (6 désoxy L galactose) Glucosamine et galactosamine souvent acétylées Acide N-acétylneuraminique (NANA) souvent terminal qui donne leur caractère acide aux glycoprotéines. Enchaînement glucidique souvent ramifié, caractéristique (glycosyl-transférases spécifiques). 1.5.7.3 Liaison des fractions glucidiques et protéiques La liaison se fait entre le groupement réducteur terminal de la fraction glucidique et un acide aminé de la protéine au niveau : • d’une fonction alcool d’un acide aminé

déshydrogénase http://www.brenda-enzymes.org  Toutes les informations concernant chaque enzyme Classe : 1 Oxydoréductases : réactions redox 1.1 Deshydrogénases 1.2 Oxidases 1.3 Oxygénases 1.4 Peroxydases Exemple : Glucose Oxidase (EC 1.1.3.4) 2 Transférases : transfert de groupes fonctionnels Exemple : GOT (EC 2.6.1.1) 3 Hydrolases : réactions d’hydrolyse et de condensation (inverse) Plus gros groupes : estérases, glycosidases, lipases, protéases Exemple : Chymosin (EC 3.4.23.4 : aussi appelée rennin) :

Hydrogénation d'une huile insaturée 39 3. Les molécules 3.3 Les Lipides Ce sont des esters formés entre: * 1 trialcool = glycérol * 3 acides gras CH2OH CHOH CH2OH O LES TRIGLYCERIDES Glycerol + 3 Fatty Acids Lipase Acyl transferase CH2O O Triacylglycerol HC O O 40 CH2O 3. Les molécules 3.3 Les Lipides On distingue: * les TG simples R1 = R2 = R3 * les TG mixtes R1  R2  R3 Ces TG peuvent être hydrolysés par: * des bases: TG + base * des enzymes TG peuvent

modifier de façon plus ou moins directe les taux de métabolites physiologiques :  Des antihypertenseurs (IEC)  De nombreux antibiotiques et antifongiques actifs, eux, sur les micro-organismes pathogènes. (ex : Fosfomycine enzyme de paroi : puruvyl transferase) 6  Action sur les macromolécules support de l’information génétique (ARN, ADN) : Certains PA agissent sur ces macromolécules indispensables à la synthèse des protéines cellulaires. Il importe que cette action soit limitée aux populations cellulaires

à quatre chiffres (Classe / Sous-classe / Sous-sous-classe / Ordre), un nom systématique et un nom commun recommandé (http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/). Les enzymes protéiques sont réparties en 6 classes: 1- les oxydoréductases, 2 - les transférases, 3 - les hydrolases, 4 - les lyases, 5 - les isomérases, 6 - les ligases.On notera que je n'ai pas respecté l'orthographe ANGLOSAXONNE du radical "oxid" en usage dans la classification internationale. * La réaction enzymatique peut être inhibée

fucose (6 désoxy L galactose) Glucosamine et galactosamine souvent acétylées Acide N-acétylneuraminique (NANA) souvent terminal qui donne leur caractère acide aux glycoprotéines. Enchaînement glucidique souvent ramifié, caractéristique (glycosyl-transférases spécifiques). 1.5.7.3 Liaison des fractions glucidiques et protéiques La liaison se fait entre le groupement réducteur terminal de la fraction glucidique et un acide aminé de la protéine au niveau : • d’une fonction alcool d’un acide aminé

Applications industrielles de la cutinaseP 13 Avancées dans le domaineP 14 ConclusionP 15 RéférencesP 16 Introduction 1. Généralités sur les enzymes Les enzymes sont classées en six principaux groupes : oxydo-réductases (E.C. 1), transférases (E.C. 2), hydrolases (E.C. 3), lyases (E.C.4), isomérases (E.C. 5) et ligases (E.C. 6). Les enzymes sont généralement nommées en additionnant le suffixe –ase au nom de leur substrat et sont classées par un système numérique standard. Leur numéro

enzymes qui transportent un groupement amine d’un acide aminé à un acide cétonique avec formation d’un nouvel acide alpha cétonique. Deux enzymes sont importantes : * ASAT-(GOT) = Laspartate 2 oxoglutarate amino-transferase * ALAT-(GPT) = L alanine 2 oxoglutarate amino-transferase L’ALAT est présenté dans le foie mais aussi dans le myocarde et le muscle squelettique 3-Mode opératoire  * Longueur d’onde : 340 nm * Température d’incubation : 25-37 C Le mode

44 Abréviations AcOEt Acétate d’éthyle ADN Acide désoxyribonucléique CG Cytosine-guanine CH2Cl2 Dichlorométhane CH3CN Acétonitrile Et2O Diéthylether EtOH Ethanol Eq. Equivalent DMF Diméthylformarmamide DNMT DNA Methyl Transferase HCl Acide chlorhydrique HFE Perfluorobutylméthyl ether Hz Hertz MBD Methylated binding protein MeOH Méthanol MgSO4 Sulfate de magnésium NaHCO3 Carbonate de sodium Py Pyridine RMN Résonance magnétique nucléaire THF Tétrahydrofurane TMSCl