Substrat enzymatique

temporairement le substrat et de catalyser la réaction sur ce substrat. Il se compose d'acides aminés non consécutifs dans la structure primaire de la protéine, qui sont rapprochés par le repliement de la molécule, certains sont des acides aminés de liaison au substrat, d'autres sont des acides aminés catalytiques, c'est le site actif qui détermine la spécificité de subsrat et d'action de l'enzyme. - Complexe Enzyme-Substrat : Association spécifique et temporaire de l'enzyme et de son substrat en vue d'une

concentration et de la concentration du substrat -Étudier l'effet de la concentration sur l'activité enzymatique -Déterminer la vitesse maximale Vmax et la constante de Michaelis Km. Introduction La cinétique concerne l'étude des vitesses de réactions ainsi que les conditions qui influencent cette vitesse de réaction.

Détermination du pH optimum pour l’enzyme α-amylase en étudiant la réaction d’hydrolyse de l’amidon à différents pH But : Montrer et déterminer la valeur d’un pH optimum spécifique à l’enzyme α-amylase. Pour se faire on étudie son activité enzymatique par spectrophotométrie dans une réaction d’hydrolyse de l’amidon à différents pH. Calcul de concentration en amidon en mol/L : Ci × Vi = Cf × Vf Vi = ((1 × 100 × 10⁻⁶) )/25 = 4 × 10⁻⁶ 4 μL à prélever pour une concentration 1g/L

la désignation des enzymes. Là où la nomenclature officielle diffère sensiblement de la nomenclature usuelle, c'est qu'elle désigne les enzymes en fonction des réactions qu'ils catalysent et non en fonction de la molécule qui possède l'activité enzymatique. Le code qui permet de désigner un enzyme de façon systématique a la forme : EC (chiffre de 1 à 6). (Chiffre). (Chiffre). (Chiffre) : "EC" désigne la commission des enzymes. Le premier chiffre classe l'enzyme dans l'une des six classes d'enzymes:

~~~~~~~~~~ DEPARTEMENT DE BIOCHIMIE ET BIOLOGIE MOLECULAIRE ~~~~~~~~~~ PCEM 1 Biochimie Structurale ENZYMES CO-ENZYMES ~~~~~~~~~~ Pr Marc Denis Année Universitaire 2007-2008 2/22 ENZYMOLOGIE 1. GENERALITES 1.1. Définitions 1.1.1. Enzyme 1.1.2. Substrat – Produit 1.1.3. Site actif 1.2. Mode d’action Diagramme d'une réaction catalytique qui montre l'énergie (E) requise à différentes étapes suivant l'axe du temps (t). 1.3. Caractéristiques CH 2 OH O O β R + H2O β Galactosidase β D Galactoside

R-O-PO32- + H2O  R-OH + HPO42- Méthodologie La manipulation permet l'étude de l'influence de plusieurs facteurs sur la réaction enzymatique. L'enzyme utilisée est une préparation commerciale partiellement purifiée de phosphatase intestinale de veau, la réaction sera suivie en dosant les produits apparus dans le milieu lorsque l'enzyme est mise en présence du substrat. Pour des raisons de commodité, ce dernier est le p-nitrophényl phosphate (PNPP), composé incolore qui libère par hydrolyse du p-nitrophénol

s’agit de la précipitation au BaCl2. La deuxième étape est une chromatographie échangeuse d’ions sur une colonne Diéthyl-amino-ethyl(DEAE)-Sephadex A-50 chargée positivement avec une élution de la prothrombine grâce un gradient de NaCl. Un test enzymatique nous permettra de suivre spécifiquement cette activité. II. Introduction La prothrombine est une chaîne polypeptidique précurseur de la thrombine. La thrombine, dans l'organisme sain joue un rôle important en déclenchant la première phase de

simplification des macronutriments en nutriments ( petites molécules directement assimilables par l'organisme ) La digestion qui a lieu dans le tube digestif consiste en deux types d'action : la digestion mécanique la digestion chimique ou enzymatique 1- La digestion mécanique => Il s'agit de mouvements mécaniques ( ex : brassage, péristaltisme ) réalisés par les muscles contenues dans la paroi des organes du tube, permettant : d'une part l'avancée des aliments produits de la digestion

est précédée par la fixation de la molécule de substrat au niveau d'une région particulière de l'enzyme: .... On considère deux modèles d'interactions (il en existe des variantes : modèle"rack"Henry Eyring et Rufus Lumry (1954) ; modèle strain" Williams Jenks (1966)) Modèle de Fischer : Modèle de Koschland [pic] Le site actif est ainsi schématisé comme étant une "crevasse" tapissée par des acides aminés impliqués dans la fixation du substrat et d'autres dans le mécanisme de catalyse. Ainsi

La molécule A se transforme en molécule B grâce au site actif (cf L2)Les enzymes sont retrouvées intactes en fin de réactionElles peuvent être réutilisées jusqu’à 100 000 fois par minuteSaccharose ---- Elles sont spécifiques de leur substrat Cas du saccharose : -fructosidase Spécificité des enzymesLes enzymes sont des catalyseurs spécifiquesUne enzyme donnée (il y en a des milliers de sortes différentes) ne